基因擴增的基本要素及PCR基因擴增儀的三步基本反應
1、基因擴增的基本要素
基因擴增的基本要素與DNA復制的基本要素是一致的。
?、貲NA模板:待拷貝的DNA稱為模板,它可以是雙鏈DNA也可是單鏈DNA,后擴增得到的產(chǎn)物是雙鏈狀態(tài)的。
②引物:是DNA復制的先鋒,就象結晶過程中的晶核,引導DNA的合成。在PCR擴增中一般使用合成的寡核苷酸作引物。
?、跠NA聚合酶(TaqDNA聚合酶):是DNA復制的動力,在dNTP等底物存在時在引物的引導下沿著模板DNA合成互補的DNA鏈。
?、芫彌_液:提供DNA合成反應所需的pH,離子強度等環(huán)境。
?、?種單核苷酸:dNTP,提供DNA合成原料。
2、基因擴增儀原理
基因擴增儀是利用PCR技術對特定基因做體外的大量合成,用于以檢測DNA/RNA為目的的各種基因分析。
PCR反應一般設置20~40次循環(huán),每一循環(huán)包括高溫變性、低溫退火、中溫延伸三步反應。每一循環(huán)的產(chǎn)物作為下一個循環(huán)的模板。PCR的擴增效率很高,如果循環(huán)次數(shù)是30次,那么新生DNA片段理論上達到230拷貝(約為109個分子)。
1.模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結合,為下輪反應作準備;
2.模板DNA與引物的退火(復性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結合;
3.引物的延伸:DNA模板-引物結合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,按堿基配對與半保留復制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復制鏈重復循環(huán)變性、退火、延伸三過程,就可獲得更多的“半保留復制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2~4分鐘,2~3小時就能將待擴增的目的基因擴增放大幾百萬倍。
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